Treść
Strona głównaPublikacje

Pobierz A new strategy for gene targeting and functional proteomics using the DT40 cell line

Nazwa projektu

Funkcjonalne zróżnicowanie niekodujących RNA u Eukariota

Abstrakt

DT40 cells derived from chicken B lymphocytes exhibit exceptionally high homologous recombination rates. Therefore, they can be used as a convenient tool and model for gene targeting experiments. However, lack of efficient cloning strategies, protein purification protocols and a well annotated protein database limits the utility of these cells for proteomic studies. Here we describe a fast and inexpensive experimental pipeline for protein localization, quantification and mass spectrometry– based interaction studies using DT40 cells. Our newly designed set of pQuant vectors and a sequence- and ligation-independent cloning (SLIC) strategy allow for simple and efficient generation of gene targeting constructs, facilitating homologousrecombination– based protein tagging on a multigene scale. We also report proof of principle results using the key proteins involved in RNA decay, namely EXOSC8, EXOSC9, CNOT7 and UPF1.


powrót

Newsletter
 
Logo Swiss Contribution
Logo - Polsko-Szwajcarski Program Badawczy
Logo - Ośrodek Przetwarzania Informacji - Państwowy Instytut Badawczy

Projekt współfinansowany przez Szwajcarię w ramach szwajcarskiego programu współpracy z nowymi krajami członkowskimi Unii Europejskiej

Logo Swiss Contribution
Logo - Polsko-Szwajcarski Program Badawczy
Logo - Ośrodek Przetwarzania Informacji - Państwowy Instytut Badawczy

Projekt współfinansowany przez Szwajcarię w ramach szwajcarskiego programu współpracy z nowymi krajami członkowskimi Unii Europejskiej

Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa WyższegoNarodowe Centrum NaukiNarodowe Centrum Badań i RozwojuCreative Communication ClusterPortal Funduszy EuropejskichKreoBox - miejsce spotkań biznesu, nauki i inwestorów

Ośrodek Przetwarzania Informacji - Państwowy Instytut Badawczy, al. Niepodległości 188 b, 00-608 Warszawa, tel. +48 22 57 01 400, fax. +48 22 825 33 19, e-mail: opi@opi.org.pl

Ten serwis wykorzystuje pliki cookies

Używamy cookies i podobnych technologii m.in. w celu świadczenia usług i w celach statystycznych. Możesz określić warunki przechowywania lub dostępu do plików cookies w Twojej przeglądarce, w jej ustawieniach. Jeżeli wyrażasz zgodę na zapisywanie informacji zawartej w cookies, kliknij „Zamknij”. Jeżeli nie wyrażasz zgody – zmień ustawienia swojej przeglądarki. Więcej informacji znajdziesz w naszejPolityce cookies

Zamknij